畿内を掌握し始めた信長（染谷将太）はますます権力を強め、朝廷での地位もバク上がり。しかし、長引く本願寺との戦にイライラも募る。十兵衛は怪我と心労でついに倒れてしまう。

十兵衛（長谷川博己）のもとに稲葉一鉄（村田雄浩）に仕えていた斎藤利三（須賀貴匡）という男が転がり込んできた。稲葉と揉めて逃げてきたという。利三は十兵衛に仕えたいというが、そのことがキッカケとなり、十兵衛は新たな戦に駆り出されることになる。

将軍・足利義昭（滝藤賢一）は信長（染谷将太）に対し兵を挙げる。しかし頼りにしていた武田信玄（石橋凌）や浅井・朝倉勢が一向に現れない....

十兵衛（長谷川博己）は三条西実澄（石橋蓮司）のおかげで帝（坂東玉三郎）に声をかけられる。松永久秀（吉田鋼太郎）と筒井順慶（駿河太郎）の争いが再燃し、将軍・義昭（滝藤賢一）が介入、信長（染谷将太）も出兵をうながされていたが...

比叡山延暦寺の戦で大きな功績をあげ、坂本に新しく城を築城中の十兵衛。信長の信頼は厚いが、幕府の信長に対する不信感は強まり、十兵衛に対する風当たりも強くなり...